شهر بوستان زر در کنارگذر سمت چپ اتوبان اصفهان_شهرکرد ( اتوبان ذوب آهن ) در فاصله ۱۶ کیلومتری شهر اصفهان و در عرض جغرافیایی ۳۳ درجه و ۲۹ دقیقه به طول جغرافیایی ۵۱ درجه و ۳۰ دقیقه در ۶ کیلومتری شهرستان فلاورجان قرار گرفته است. وسعت محدوده آن ۱۰۸۶۹۳۲ متر مربع و وسعت حریم آن ۲۶۴۱۸۰۰ مترمربع می باشد. این شهر از سمت شمال به رودخانه زاینده رود به طول ۳/۵ کیلومتر و کوه اجگرد، از سمت جنوب به روستای مهرنجان ارامنه ، از سمت شرق با روستای اردال و بجگرد و از سمت غرب با روستای زفره همسایه است .